著作
長崎の鐘 （1946年8月脱稿／1949年1月発行）
初版
ロザリオの鎖 （1948年3月脱稿）
この子を残して （1948年4月脱稿）
亡びぬものを （1948年1月脱稿）
生命の河 （1948年8月脱稿）
如己堂随筆 （1957年12月発行）
乙女峠 （1951年4月脱稿／1952年9月発行）
いとし子よ （1949年10月発行）
花咲く丘 （1949年4月脱稿）
原子野録音 （1947-1951聖母の騎士誌連載）
平和塔 （1979年11月発行）
村医 （1978年4月発行）
長崎の花上・中・下 （1950- 日刊東京タイムス連載）
編集
原子雲の下に生きて （1949年発行）
私達は長崎にいた （1952年10月）
翻訳
世界と肉体とスミス神父 （1947年12月発行）
野鼠 （1949年7月）
論文と講演
原子病と原子医学 （1946年11月長崎医学会）
壕舎随想 （1946年10月長崎医師会館）
関係出版物
永井隆の生涯 （片岡弥吉著）
長崎原爆記 （秋月辰一郎著）
長崎の鐘はほほえむ （永井誠一著）
娘よここが長崎です （筒井茅乃著）
永井博士を憶う （如己堂会編）
長崎の歌 （パウロ・グリン著）
永井隆博士 （富田邦彦著）